Mellan 1992 och 2014 var Magnus arkivets chef och han fortsatte arbeta aktivt, nästan in i det sista, med arkivets samlingar. Med Smålands Musikarkiv och Musik i Syd som bas bearbetade Magnus samlingarna akademiskt, populärvetenskapligt och inte minst konstnärligt som musiker. Det skedde inte sällan i form av skivutgåvor med fylliga texthäften, notböcker, föredrag, konferenser och konserter.
Magnus stora musikkunskaper gjorde honom till auktoritet att vända sig till, såväl för medarbetarna inom arkivet, som för många inom Folkmusiksverige. Han var alltid hjälpsam och tog sig tid och kunde dessutom berätta fantastiska historier om musik och musiker. Saknaden är stor, liksom tacksamheten för allt Magnus Gustafsson hann dela med sig av.
